Protein–RNA interactions for Protein: P70257

Nfix, Nuclear factor 1 X-type, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfixP70257 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NfixP70257 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NfixP70257 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NfixP70257 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NfixP70257 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NfixP70257 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NfixP70257 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NfixP70257 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NfixP70257 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NfixP70257 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NfixP70257 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NfixP70257 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NfixP70257 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NfixP70257 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NfixP70257 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NfixP70257 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NfixP70257 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NfixP70257 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NfixP70257 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfixP70257 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfixP70257 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfixP70257 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfixP70257 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfixP70257 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfixP70257 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfixP70257 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfixP70257 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfixP70257 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NfixP70257 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NfixP70257 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfixP70257 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfixP70257 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfixP70257 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfixP70257 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfixP70257 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfixP70257 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfixP70257 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfixP70257 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfixP70257 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfixP70257 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfixP70257 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfixP70257 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfixP70257 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfixP70257 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
NfixP70257 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
NfixP70257 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfixP70257 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfixP70257 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfixP70257 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfixP70257 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NfixP70257 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfixP70257 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NfixP70257 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfixP70257 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfixP70257 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfixP70257 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfixP70257 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfixP70257 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfixP70257 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfixP70257 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfixP70257 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfixP70257 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfixP70257 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfixP70257 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfixP70257 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NfixP70257 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NfixP70257 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NfixP70257 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NfixP70257 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NfixP70257 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NfixP70257 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NfixP70257 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NfixP70257 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NfixP70257 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NfixP70257 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NfixP70257 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NfixP70257 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NfixP70257 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NfixP70257 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NfixP70257 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NfixP70257 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NfixP70257 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NfixP70257 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NfixP70257 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NfixP70257 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NfixP70257 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NfixP70257 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NfixP70257 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NfixP70257 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NfixP70257 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NfixP70257 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NfixP70257 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NfixP70257 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NfixP70257 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NfixP70257 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NfixP70257 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NfixP70257 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NfixP70257 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NfixP70257 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NfixP70257 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms