Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lmo4P61969 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Lmo4P61969 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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