Protein–RNA interactions for Protein: P61092

Siah1a, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1A, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1aP61092 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Siah1aP61092 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Siah1aP61092 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Siah1aP61092 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Siah1aP61092 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Siah1aP61092 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Siah1aP61092 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Siah1aP61092 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Siah1aP61092 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Siah1aP61092 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Siah1aP61092 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah1aP61092 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah1aP61092 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah1aP61092 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah1aP61092 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah1aP61092 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah1aP61092 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah1aP61092 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah1aP61092 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah1aP61092 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah1aP61092 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah1aP61092 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah1aP61092 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah1aP61092 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah1aP61092 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah1aP61092 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah1aP61092 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah1aP61092 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah1aP61092 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah1aP61092 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah1aP61092 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah1aP61092 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah1aP61092 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah1aP61092 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah1aP61092 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah1aP61092 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah1aP61092 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah1aP61092 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah1aP61092 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah1aP61092 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Siah1aP61092 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Siah1aP61092 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Siah1aP61092 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Siah1aP61092 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Siah1aP61092 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Siah1aP61092 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Siah1aP61092 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Siah1aP61092 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Siah1aP61092 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Siah1aP61092 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Siah1aP61092 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Siah1aP61092 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Siah1aP61092 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Siah1aP61092 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Siah1aP61092 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Siah1aP61092 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Siah1aP61092 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Siah1aP61092 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Siah1aP61092 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Siah1aP61092 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Siah1aP61092 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Siah1aP61092 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Siah1aP61092 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Siah1aP61092 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Siah1aP61092 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Siah1aP61092 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Siah1aP61092 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Siah1aP61092 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Siah1aP61092 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Siah1aP61092 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Siah1aP61092 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Siah1aP61092 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Siah1aP61092 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Siah1aP61092 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Siah1aP61092 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Siah1aP61092 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Siah1aP61092 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Siah1aP61092 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Siah1aP61092 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Siah1aP61092 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Siah1aP61092 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Siah1aP61092 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Siah1aP61092 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Siah1aP61092 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Siah1aP61092 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Siah1aP61092 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Siah1aP61092 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Siah1aP61092 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Siah1aP61092 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Siah1aP61092 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Siah1aP61092 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Siah1aP61092 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Siah1aP61092 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Siah1aP61092 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Siah1aP61092 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Siah1aP61092 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Siah1aP61092 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Siah1aP61092 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Siah1aP61092 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Siah1aP61092 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms