Protein–RNA interactions for Protein: P61014

Pln, Cardiac phospholamban, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PlnP61014 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PlnP61014 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PlnP61014 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PlnP61014 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PlnP61014 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PlnP61014 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PlnP61014 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PlnP61014 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PlnP61014 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PlnP61014 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
PlnP61014 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PlnP61014 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PlnP61014 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PlnP61014 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PlnP61014 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PlnP61014 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PlnP61014 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PlnP61014 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PlnP61014 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PlnP61014 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PlnP61014 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PlnP61014 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PlnP61014 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PlnP61014 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
PlnP61014 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PlnP61014 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
PlnP61014 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PlnP61014 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
PlnP61014 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PlnP61014 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PlnP61014 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PlnP61014 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PlnP61014 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PlnP61014 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PlnP61014 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PlnP61014 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PlnP61014 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PlnP61014 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PlnP61014 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PlnP61014 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PlnP61014 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PlnP61014 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PlnP61014 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PlnP61014 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PlnP61014 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PlnP61014 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PlnP61014 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PlnP61014 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PlnP61014 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PlnP61014 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PlnP61014 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PlnP61014 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PlnP61014 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PlnP61014 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PlnP61014 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PlnP61014 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PlnP61014 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PlnP61014 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
PlnP61014 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PlnP61014 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PlnP61014 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PlnP61014 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PlnP61014 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PlnP61014 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PlnP61014 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PlnP61014 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PlnP61014 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
PlnP61014 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PlnP61014 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
PlnP61014 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PlnP61014 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PlnP61014 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PlnP61014 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
PlnP61014 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
PlnP61014 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PlnP61014 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PlnP61014 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
PlnP61014 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PlnP61014 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
PlnP61014 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
PlnP61014 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
PlnP61014 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
PlnP61014 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
PlnP61014 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
PlnP61014 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
PlnP61014 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
PlnP61014 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PlnP61014 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
PlnP61014 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
PlnP61014 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PlnP61014 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PlnP61014 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
PlnP61014 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PlnP61014 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
PlnP61014 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PlnP61014 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PlnP61014 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PlnP61014 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PlnP61014 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PlnP61014 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.3 ms