Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snap25P60879 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snap25P60879 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snap25P60879 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Snap25P60879 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Snap25P60879 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms