Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hps5P59438 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hps5P59438 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hps5P59438 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hps5P59438 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hps5P59438 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hps5P59438 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hps5P59438 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hps5P59438 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hps5P59438 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms