Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms