Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms