Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms