Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Setd4P58467 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Setd4P58467 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Setd4P58467 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Setd4P58467 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Setd4P58467 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Setd4P58467 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Setd4P58467 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Setd4P58467 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Setd4P58467 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Setd4P58467 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Setd4P58467 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Setd4P58467 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Setd4P58467 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Setd4P58467 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Setd4P58467 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Setd4P58467 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Setd4P58467 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Setd4P58467 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Setd4P58467 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Setd4P58467 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Setd4P58467 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Setd4P58467 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Setd4P58467 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Setd4P58467 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Setd4P58467 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Setd4P58467 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Setd4P58467 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Setd4P58467 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Setd4P58467 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Setd4P58467 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Setd4P58467 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Setd4P58467 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Setd4P58467 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Setd4P58467 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Setd4P58467 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Setd4P58467 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Setd4P58467 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Setd4P58467 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Setd4P58467 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Setd4P58467 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Setd4P58467 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Setd4P58467 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Setd4P58467 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Setd4P58467 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Setd4P58467 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Setd4P58467 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Setd4P58467 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Setd4P58467 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Setd4P58467 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Setd4P58467 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Setd4P58467 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms