Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms