Protein–RNA interactions for Protein: P57748

Mmp20, Matrix metalloproteinase-20, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp20P57748 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms