Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

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Length 1,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp25P57080 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp25P57080 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Usp25P57080 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp25P57080 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Usp25P57080 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp25P57080 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Usp25P57080 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Usp25P57080 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Usp25P57080 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp25P57080 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp25P57080 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Usp25P57080 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Usp25P57080 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Usp25P57080 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Usp25P57080 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Usp25P57080 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp25P57080 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Usp25P57080 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Usp25P57080 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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