Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bace1P56818 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bace1P56818 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bace1P56818 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Bace1P56818 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Bace1P56818 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bace1P56818 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bace1P56818 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Bace1P56818 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Bace1P56818 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms