Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh3bp1P55194 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh3bp1P55194 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh3bp1P55194 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC15.08■□□□□ 0
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Sh3bp1P55194 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh3bp1P55194 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
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Sh3bp1P55194 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Sh3bp1P55194 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Sh3bp1P55194 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Sh3bp1P55194 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3bp1P55194 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3bp1P55194 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3bp1P55194 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3bp1P55194 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3bp1P55194 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3bp1P55194 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3bp1P55194 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3bp1P55194 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sh3bp1P55194 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sh3bp1P55194 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sh3bp1P55194 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sh3bp1P55194 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sh3bp1P55194 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sh3bp1P55194 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sh3bp1P55194 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
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