Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Aqp4P55088 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Aqp4P55088 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Aqp4P55088 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Aqp4P55088 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Aqp4P55088 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Aqp4P55088 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Aqp4P55088 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms