Protein–RNA interactions for Protein: P51180

Mip, Lens fiber major intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MipP51180 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MipP51180 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MipP51180 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MipP51180 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
MipP51180 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MipP51180 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
MipP51180 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MipP51180 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MipP51180 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
MipP51180 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
MipP51180 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
MipP51180 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MipP51180 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MipP51180 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MipP51180 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MipP51180 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MipP51180 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MipP51180 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MipP51180 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MipP51180 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
MipP51180 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MipP51180 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MipP51180 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MipP51180 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MipP51180 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MipP51180 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MipP51180 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MipP51180 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MipP51180 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MipP51180 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
MipP51180 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
MipP51180 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MipP51180 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MipP51180 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MipP51180 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MipP51180 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MipP51180 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MipP51180 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MipP51180 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
MipP51180 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
MipP51180 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MipP51180 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MipP51180 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MipP51180 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MipP51180 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MipP51180 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MipP51180 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MipP51180 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MipP51180 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MipP51180 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MipP51180 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
MipP51180 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MipP51180 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MipP51180 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MipP51180 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MipP51180 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MipP51180 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MipP51180 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MipP51180 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MipP51180 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MipP51180 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
MipP51180 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
MipP51180 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MipP51180 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MipP51180 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MipP51180 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MipP51180 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MipP51180 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MipP51180 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MipP51180 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MipP51180 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MipP51180 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MipP51180 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MipP51180 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MipP51180 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
MipP51180 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MipP51180 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MipP51180 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MipP51180 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MipP51180 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MipP51180 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MipP51180 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MipP51180 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MipP51180 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MipP51180 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MipP51180 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MipP51180 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MipP51180 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MipP51180 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MipP51180 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MipP51180 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MipP51180 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MipP51180 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MipP51180 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MipP51180 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MipP51180 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MipP51180 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MipP51180 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MipP51180 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MipP51180 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms