Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SftpbP50405 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SftpbP50405 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SftpbP50405 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SftpbP50405 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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SftpbP50405 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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SftpbP50405 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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SftpbP50405 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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SftpbP50405 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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SftpbP50405 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SftpbP50405 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SftpbP50405 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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