Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LtbrP50284 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LtbrP50284 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LtbrP50284 AC124408.1-201ENSMUST00000228938 707 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LtbrP50284 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Gm28745-201ENSMUST00000190069 305 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LtbrP50284 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LtbrP50284 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LtbrP50284 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
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LtbrP50284 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LtbrP50284 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms