Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Hoxc13P50207 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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