Protein–RNA interactions for Protein: P49935

Ctsh, Pro-cathepsin H, mousemouse

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Length 333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtshP49935 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtshP49935 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtshP49935 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtshP49935 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtshP49935 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CtshP49935 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtshP49935 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtshP49935 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtshP49935 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtshP49935 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CtshP49935 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtshP49935 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtshP49935 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtshP49935 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CtshP49935 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CtshP49935 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtshP49935 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtshP49935 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CtshP49935 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtshP49935 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtshP49935 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtshP49935 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtshP49935 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtshP49935 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CtshP49935 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtshP49935 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtshP49935 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtshP49935 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtshP49935 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtshP49935 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtshP49935 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtshP49935 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtshP49935 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtshP49935 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtshP49935 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtshP49935 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtshP49935 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtshP49935 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtshP49935 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtshP49935 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtshP49935 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CtshP49935 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CtshP49935 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CtshP49935 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CtshP49935 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtshP49935 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CtshP49935 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtshP49935 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtshP49935 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtshP49935 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtshP49935 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtshP49935 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtshP49935 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtshP49935 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtshP49935 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtshP49935 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtshP49935 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtshP49935 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtshP49935 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtshP49935 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CtshP49935 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtshP49935 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtshP49935 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtshP49935 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtshP49935 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtshP49935 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtshP49935 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtshP49935 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtshP49935 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtshP49935 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtshP49935 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtshP49935 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtshP49935 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtshP49935 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CtshP49935 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CtshP49935 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CtshP49935 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtshP49935 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtshP49935 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtshP49935 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CtshP49935 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CtshP49935 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtshP49935 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CtshP49935 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CtshP49935 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtshP49935 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtshP49935 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtshP49935 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtshP49935 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtshP49935 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtshP49935 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtshP49935 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtshP49935 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtshP49935 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtshP49935 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtshP49935 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtshP49935 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtshP49935 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtshP49935 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtshP49935 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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