Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbp3P49194 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp3P49194 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp3P49194 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp3P49194 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp3P49194 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp3P49194 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp3P49194 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp3P49194 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp3P49194 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp3P49194 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp3P49194 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp3P49194 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp3P49194 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp3P49194 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp3P49194 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp3P49194 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp3P49194 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp3P49194 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp3P49194 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp3P49194 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp3P49194 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp3P49194 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp3P49194 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp3P49194 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp3P49194 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp3P49194 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp3P49194 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp3P49194 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp3P49194 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp3P49194 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp3P49194 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp3P49194 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp3P49194 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp3P49194 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp3P49194 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp3P49194 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp3P49194 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp3P49194 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp3P49194 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp3P49194 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp3P49194 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp3P49194 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp3P49194 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp3P49194 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp3P49194 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp3P49194 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp3P49194 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp3P49194 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rbp3P49194 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rbp3P49194 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rbp3P49194 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rbp3P49194 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rbp3P49194 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rbp3P49194 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rbp3P49194 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbp3P49194 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rbp3P49194 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbp3P49194 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbp3P49194 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbp3P49194 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rbp3P49194 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rbp3P49194 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rbp3P49194 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbp3P49194 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbp3P49194 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbp3P49194 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbp3P49194 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbp3P49194 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbp3P49194 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbp3P49194 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rbp3P49194 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rbp3P49194 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rbp3P49194 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbp3P49194 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rbp3P49194 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rbp3P49194 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbp3P49194 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rbp3P49194 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbp3P49194 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbp3P49194 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rbp3P49194 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbp3P49194 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rbp3P49194 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbp3P49194 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbp3P49194 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rbp3P49194 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbp3P49194 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbp3P49194 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbp3P49194 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbp3P49194 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbp3P49194 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbp3P49194 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbp3P49194 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rbp3P49194 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbp3P49194 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbp3P49194 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rbp3P49194 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbp3P49194 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbp3P49194 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms