Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

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Length 858 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Epb41P48193 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Epb41P48193 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Epb41P48193 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Epb41P48193 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Epb41P48193 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Epb41P48193 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Epb41P48193 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Epb41P48193 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Epb41P48193 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Epb41P48193 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Epb41P48193 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Epb41P48193 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Epb41P48193 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Epb41P48193 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Epb41P48193 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Epb41P48193 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Epb41P48193 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Epb41P48193 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Epb41P48193 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Epb41P48193 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Epb41P48193 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Epb41P48193 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Epb41P48193 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Epb41P48193 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Epb41P48193 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Epb41P48193 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Epb41P48193 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Epb41P48193 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Epb41P48193 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Epb41P48193 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Epb41P48193 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Epb41P48193 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Epb41P48193 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Epb41P48193 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Epb41P48193 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Epb41P48193 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Epb41P48193 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Epb41P48193 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Epb41P48193 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Epb41P48193 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Epb41P48193 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Epb41P48193 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Epb41P48193 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Epb41P48193 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Epb41P48193 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Epb41P48193 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Epb41P48193 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Epb41P48193 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Epb41P48193 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Epb41P48193 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Epb41P48193 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Epb41P48193 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Epb41P48193 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Epb41P48193 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Epb41P48193 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Epb41P48193 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Epb41P48193 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Epb41P48193 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Epb41P48193 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Epb41P48193 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Epb41P48193 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Epb41P48193 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Epb41P48193 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Epb41P48193 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Epb41P48193 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Epb41P48193 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Epb41P48193 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Epb41P48193 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Epb41P48193 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Epb41P48193 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Epb41P48193 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Epb41P48193 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Epb41P48193 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Epb41P48193 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Epb41P48193 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Epb41P48193 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms