Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SrprbP47758 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SrprbP47758 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SrprbP47758 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SrprbP47758 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SrprbP47758 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrprbP47758 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms