Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ItgavP43406 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ItgavP43406 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
ItgavP43406 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
ItgavP43406 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ItgavP43406 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms