Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf1P39428 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf1P39428 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf1P39428 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf1P39428 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf1P39428 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf1P39428 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf1P39428 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf1P39428 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf1P39428 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Traf1P39428 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf1P39428 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf1P39428 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf1P39428 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf1P39428 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf1P39428 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf1P39428 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms