Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TtlP38585 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TtlP38585 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
TtlP38585 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TtlP38585 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TtlP38585 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TtlP38585 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TtlP38585 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TtlP38585 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
TtlP38585 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TtlP38585 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TtlP38585 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TtlP38585 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TtlP38585 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
TtlP38585 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TtlP38585 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TtlP38585 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TtlP38585 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TtlP38585 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TtlP38585 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TtlP38585 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TtlP38585 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TtlP38585 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TtlP38585 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TtlP38585 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TtlP38585 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TtlP38585 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TtlP38585 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TtlP38585 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TtlP38585 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TtlP38585 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TtlP38585 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TtlP38585 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TtlP38585 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TtlP38585 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TtlP38585 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TtlP38585 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TtlP38585 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TtlP38585 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TtlP38585 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TtlP38585 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TtlP38585 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TtlP38585 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
TtlP38585 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TtlP38585 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
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TtlP38585 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TtlP38585 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TtlP38585 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
TtlP38585 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TtlP38585 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
TtlP38585 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TtlP38585 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TtlP38585 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TtlP38585 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TtlP38585 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TtlP38585 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TtlP38585 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TtlP38585 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TtlP38585 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TtlP38585 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TtlP38585 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TtlP38585 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TtlP38585 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TtlP38585 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TtlP38585 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TtlP38585 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TtlP38585 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TtlP38585 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TtlP38585 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TtlP38585 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TtlP38585 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TtlP38585 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TtlP38585 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TtlP38585 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TtlP38585 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
TtlP38585 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
TtlP38585 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TtlP38585 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TtlP38585 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TtlP38585 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TtlP38585 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TtlP38585 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TtlP38585 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TtlP38585 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TtlP38585 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TtlP38585 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TtlP38585 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TtlP38585 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TtlP38585 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TtlP38585 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TtlP38585 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TtlP38585 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TtlP38585 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TtlP38585 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TtlP38585 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TtlP38585 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TtlP38585 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TtlP38585 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TtlP38585 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms