Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms