Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms