Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Saa4P31532 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Saa4P31532 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Saa4P31532 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Saa4P31532 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Saa4P31532 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Saa4P31532 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Saa4P31532 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Saa4P31532 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Saa4P31532 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Saa4P31532 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Saa4P31532 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Saa4P31532 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Saa4P31532 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Saa4P31532 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Saa4P31532 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Saa4P31532 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Saa4P31532 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Saa4P31532 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Saa4P31532 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Saa4P31532 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Saa4P31532 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Saa4P31532 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Saa4P31532 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Saa4P31532 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Saa4P31532 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Saa4P31532 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Saa4P31532 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Saa4P31532 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Saa4P31532 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Saa4P31532 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Saa4P31532 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Saa4P31532 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Saa4P31532 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Saa4P31532 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Saa4P31532 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Saa4P31532 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Saa4P31532 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Saa4P31532 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Saa4P31532 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Saa4P31532 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Saa4P31532 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Saa4P31532 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Saa4P31532 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Saa4P31532 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Saa4P31532 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Saa4P31532 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Saa4P31532 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Saa4P31532 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Saa4P31532 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Saa4P31532 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Saa4P31532 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Saa4P31532 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Saa4P31532 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Saa4P31532 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Saa4P31532 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Saa4P31532 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Saa4P31532 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Saa4P31532 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Saa4P31532 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Saa4P31532 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Saa4P31532 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Saa4P31532 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Saa4P31532 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Saa4P31532 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Saa4P31532 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Saa4P31532 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Saa4P31532 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Saa4P31532 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Saa4P31532 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Saa4P31532 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Saa4P31532 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Saa4P31532 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Saa4P31532 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Saa4P31532 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Saa4P31532 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Saa4P31532 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Saa4P31532 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Saa4P31532 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Saa4P31532 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Saa4P31532 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Saa4P31532 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Saa4P31532 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Saa4P31532 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Saa4P31532 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Saa4P31532 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Saa4P31532 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Saa4P31532 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Saa4P31532 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Saa4P31532 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Saa4P31532 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Saa4P31532 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Saa4P31532 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Saa4P31532 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Saa4P31532 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Saa4P31532 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Saa4P31532 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Saa4P31532 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Saa4P31532 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Saa4P31532 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms