Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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