Protein–RNA interactions for Protein: P28704

Rxrb, Retinoic acid receptor RXR-beta, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrbP28704 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RxrbP28704 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RxrbP28704 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RxrbP28704 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RxrbP28704 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RxrbP28704 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RxrbP28704 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RxrbP28704 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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