Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RxraP28700 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RxraP28700 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RxraP28700 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RxraP28700 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RxraP28700 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RxraP28700 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RxraP28700 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RxraP28700 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RxraP28700 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RxraP28700 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RxraP28700 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RxraP28700 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RxraP28700 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RxraP28700 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RxraP28700 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RxraP28700 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RxraP28700 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RxraP28700 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RxraP28700 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RxraP28700 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RxraP28700 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RxraP28700 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RxraP28700 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RxraP28700 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RxraP28700 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RxraP28700 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RxraP28700 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RxraP28700 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RxraP28700 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RxraP28700 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RxraP28700 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RxraP28700 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RxraP28700 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RxraP28700 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RxraP28700 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RxraP28700 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RxraP28700 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RxraP28700 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RxraP28700 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RxraP28700 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RxraP28700 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RxraP28700 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RxraP28700 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RxraP28700 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RxraP28700 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RxraP28700 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RxraP28700 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RxraP28700 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RxraP28700 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RxraP28700 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RxraP28700 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RxraP28700 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RxraP28700 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RxraP28700 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RxraP28700 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RxraP28700 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RxraP28700 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RxraP28700 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RxraP28700 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RxraP28700 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RxraP28700 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RxraP28700 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RxraP28700 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RxraP28700 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RxraP28700 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RxraP28700 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RxraP28700 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RxraP28700 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RxraP28700 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RxraP28700 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RxraP28700 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RxraP28700 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RxraP28700 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RxraP28700 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RxraP28700 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RxraP28700 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RxraP28700 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RxraP28700 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RxraP28700 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RxraP28700 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RxraP28700 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RxraP28700 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RxraP28700 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RxraP28700 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RxraP28700 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RxraP28700 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RxraP28700 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RxraP28700 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RxraP28700 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RxraP28700 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RxraP28700 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RxraP28700 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RxraP28700 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RxraP28700 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RxraP28700 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RxraP28700 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RxraP28700 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RxraP28700 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RxraP28700 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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