Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
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Pde6aP27664 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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