Protein–RNA interactions for Protein: P27090

Tgfb2, Transforming growth factor beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb2P27090 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgfb2P27090 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgfb2P27090 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgfb2P27090 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgfb2P27090 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgfb2P27090 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgfb2P27090 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgfb2P27090 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgfb2P27090 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgfb2P27090 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgfb2P27090 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgfb2P27090 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgfb2P27090 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgfb2P27090 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgfb2P27090 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgfb2P27090 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgfb2P27090 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgfb2P27090 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgfb2P27090 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgfb2P27090 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgfb2P27090 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgfb2P27090 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgfb2P27090 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgfb2P27090 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgfb2P27090 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgfb2P27090 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgfb2P27090 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgfb2P27090 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgfb2P27090 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgfb2P27090 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgfb2P27090 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgfb2P27090 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgfb2P27090 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgfb2P27090 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgfb2P27090 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgfb2P27090 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgfb2P27090 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgfb2P27090 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgfb2P27090 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgfb2P27090 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgfb2P27090 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgfb2P27090 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgfb2P27090 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgfb2P27090 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgfb2P27090 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgfb2P27090 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgfb2P27090 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgfb2P27090 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgfb2P27090 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgfb2P27090 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgfb2P27090 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgfb2P27090 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgfb2P27090 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgfb2P27090 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgfb2P27090 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgfb2P27090 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgfb2P27090 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgfb2P27090 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgfb2P27090 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgfb2P27090 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgfb2P27090 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgfb2P27090 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgfb2P27090 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgfb2P27090 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgfb2P27090 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgfb2P27090 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgfb2P27090 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgfb2P27090 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgfb2P27090 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgfb2P27090 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgfb2P27090 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgfb2P27090 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgfb2P27090 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgfb2P27090 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgfb2P27090 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgfb2P27090 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgfb2P27090 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgfb2P27090 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgfb2P27090 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgfb2P27090 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgfb2P27090 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgfb2P27090 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgfb2P27090 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgfb2P27090 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgfb2P27090 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgfb2P27090 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgfb2P27090 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgfb2P27090 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgfb2P27090 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgfb2P27090 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgfb2P27090 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgfb2P27090 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgfb2P27090 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgfb2P27090 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgfb2P27090 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgfb2P27090 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgfb2P27090 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgfb2P27090 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgfb2P27090 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgfb2P27090 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms