Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CftrP26361 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CftrP26361 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CftrP26361 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CftrP26361 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CftrP26361 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CftrP26361 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CftrP26361 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CftrP26361 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CftrP26361 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CftrP26361 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CftrP26361 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CftrP26361 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CftrP26361 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CftrP26361 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CftrP26361 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CftrP26361 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CftrP26361 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CftrP26361 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CftrP26361 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CftrP26361 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CftrP26361 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CftrP26361 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CftrP26361 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CftrP26361 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CftrP26361 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CftrP26361 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CftrP26361 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CftrP26361 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CftrP26361 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CftrP26361 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CftrP26361 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CftrP26361 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CftrP26361 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CftrP26361 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CftrP26361 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CftrP26361 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CftrP26361 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CftrP26361 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CftrP26361 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CftrP26361 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CftrP26361 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CftrP26361 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CftrP26361 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CftrP26361 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CftrP26361 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CftrP26361 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CftrP26361 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CftrP26361 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CftrP26361 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CftrP26361 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CftrP26361 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CftrP26361 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CftrP26361 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CftrP26361 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CftrP26361 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CftrP26361 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CftrP26361 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CftrP26361 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CftrP26361 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CftrP26361 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CftrP26361 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CftrP26361 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CftrP26361 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CftrP26361 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CftrP26361 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CftrP26361 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CftrP26361 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CftrP26361 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CftrP26361 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CftrP26361 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CftrP26361 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CftrP26361 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CftrP26361 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CftrP26361 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CftrP26361 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CftrP26361 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CftrP26361 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CftrP26361 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CftrP26361 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CftrP26361 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CftrP26361 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CftrP26361 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CftrP26361 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CftrP26361 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CftrP26361 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CftrP26361 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CftrP26361 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CftrP26361 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CftrP26361 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CftrP26361 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CftrP26361 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CftrP26361 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CftrP26361 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CftrP26361 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CftrP26361 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CftrP26361 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CftrP26361 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CftrP26361 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CftrP26361 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms