Protein–RNA interactions for Protein: P23708

Nfya, Nuclear transcription factor Y subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfyaP23708 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NfyaP23708 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NfyaP23708 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NfyaP23708 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NfyaP23708 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NfyaP23708 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NfyaP23708 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NfyaP23708 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NfyaP23708 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NfyaP23708 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NfyaP23708 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NfyaP23708 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NfyaP23708 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NfyaP23708 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NfyaP23708 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NfyaP23708 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NfyaP23708 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NfyaP23708 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NfyaP23708 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NfyaP23708 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NfyaP23708 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NfyaP23708 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NfyaP23708 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NfyaP23708 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
NfyaP23708 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NfyaP23708 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
NfyaP23708 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NfyaP23708 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NfyaP23708 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NfyaP23708 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NfyaP23708 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NfyaP23708 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NfyaP23708 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NfyaP23708 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NfyaP23708 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NfyaP23708 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NfyaP23708 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NfyaP23708 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NfyaP23708 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NfyaP23708 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NfyaP23708 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NfyaP23708 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NfyaP23708 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NfyaP23708 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NfyaP23708 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NfyaP23708 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
NfyaP23708 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NfyaP23708 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NfyaP23708 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NfyaP23708 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NfyaP23708 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NfyaP23708 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NfyaP23708 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NfyaP23708 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NfyaP23708 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NfyaP23708 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NfyaP23708 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NfyaP23708 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NfyaP23708 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NfyaP23708 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NfyaP23708 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NfyaP23708 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NfyaP23708 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NfyaP23708 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NfyaP23708 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NfyaP23708 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NfyaP23708 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NfyaP23708 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NfyaP23708 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
NfyaP23708 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NfyaP23708 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NfyaP23708 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NfyaP23708 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NfyaP23708 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
NfyaP23708 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
NfyaP23708 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NfyaP23708 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
NfyaP23708 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
NfyaP23708 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
NfyaP23708 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NfyaP23708 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NfyaP23708 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NfyaP23708 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NfyaP23708 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NfyaP23708 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NfyaP23708 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NfyaP23708 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NfyaP23708 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NfyaP23708 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NfyaP23708 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NfyaP23708 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NfyaP23708 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NfyaP23708 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NfyaP23708 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NfyaP23708 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NfyaP23708 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NfyaP23708 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NfyaP23708 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NfyaP23708 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NfyaP23708 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms