Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PparaP23204 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PparaP23204 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PparaP23204 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PparaP23204 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PparaP23204 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PparaP23204 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PparaP23204 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PparaP23204 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PparaP23204 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PparaP23204 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PparaP23204 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PparaP23204 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PparaP23204 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PparaP23204 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PparaP23204 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PparaP23204 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PparaP23204 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PparaP23204 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PparaP23204 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PparaP23204 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PparaP23204 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PparaP23204 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PparaP23204 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PparaP23204 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PparaP23204 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PparaP23204 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PparaP23204 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PparaP23204 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PparaP23204 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PparaP23204 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PparaP23204 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PparaP23204 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PparaP23204 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PparaP23204 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PparaP23204 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
PparaP23204 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PparaP23204 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PparaP23204 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PparaP23204 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PparaP23204 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PparaP23204 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PparaP23204 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PparaP23204 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PparaP23204 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PparaP23204 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PparaP23204 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PparaP23204 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PparaP23204 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PparaP23204 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PparaP23204 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PparaP23204 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PparaP23204 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PparaP23204 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PparaP23204 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PparaP23204 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PparaP23204 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PparaP23204 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PparaP23204 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PparaP23204 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PparaP23204 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PparaP23204 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PparaP23204 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PparaP23204 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PparaP23204 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PparaP23204 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PparaP23204 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PparaP23204 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PparaP23204 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PparaP23204 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PparaP23204 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PparaP23204 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PparaP23204 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PparaP23204 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PparaP23204 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PparaP23204 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PparaP23204 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PparaP23204 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PparaP23204 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PparaP23204 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PparaP23204 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PparaP23204 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PparaP23204 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PparaP23204 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PparaP23204 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PparaP23204 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PparaP23204 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PparaP23204 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PparaP23204 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PparaP23204 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PparaP23204 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PparaP23204 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PparaP23204 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PparaP23204 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PparaP23204 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PparaP23204 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PparaP23204 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PparaP23204 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PparaP23204 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PparaP23204 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms