Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtpraP18052 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtpraP18052 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PtpraP18052 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PtpraP18052 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtpraP18052 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtpraP18052 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtpraP18052 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtpraP18052 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtpraP18052 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PtpraP18052 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtpraP18052 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms