Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Hoxb1P17919 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Hoxb1P17919 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Hoxb1P17919 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Hoxb1P17919 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Hoxb1P17919 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
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Hoxb1P17919 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Hoxb1P17919 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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