Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PcnaP17918 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PcnaP17918 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PcnaP17918 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PcnaP17918 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PcnaP17918 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PcnaP17918 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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