Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb1P13372 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb1P13372 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb1P13372 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb1P13372 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms