Protein–RNA interactions for Protein: P0C7A0

Khdc1b, KH homology domain-containing protein 1B, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc1bP0C7A0 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms