Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Surf1P09925 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Surf1P09925 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Surf1P09925 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Surf1P09925 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Surf1P09925 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Surf1P09925 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Surf1P09925 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms