Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
TtrP07309 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
TtrP07309 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
TtrP07309 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
TtrP07309 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
TtrP07309 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
TtrP07309 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
TtrP07309 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
TtrP07309 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
TtrP07309 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
TtrP07309 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
TtrP07309 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
TtrP07309 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
TtrP07309 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
TtrP07309 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
TtrP07309 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
TtrP07309 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
TtrP07309 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
TtrP07309 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
TtrP07309 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
TtrP07309 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
TtrP07309 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
TtrP07309 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
TtrP07309 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
TtrP07309 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
TtrP07309 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
TtrP07309 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
TtrP07309 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
TtrP07309 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
TtrP07309 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
TtrP07309 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
TtrP07309 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
TtrP07309 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
TtrP07309 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
TtrP07309 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
TtrP07309 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
TtrP07309 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
TtrP07309 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
TtrP07309 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
TtrP07309 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
TtrP07309 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
TtrP07309 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
TtrP07309 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
TtrP07309 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
TtrP07309 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
TtrP07309 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
TtrP07309 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
TtrP07309 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
TtrP07309 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
TtrP07309 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
TtrP07309 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
TtrP07309 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
TtrP07309 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
TtrP07309 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
TtrP07309 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
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TtrP07309 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
TtrP07309 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
TtrP07309 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
TtrP07309 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
TtrP07309 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
TtrP07309 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
TtrP07309 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
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TtrP07309 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
TtrP07309 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
TtrP07309 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
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TtrP07309 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
TtrP07309 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
TtrP07309 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
TtrP07309 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
TtrP07309 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
TtrP07309 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
TtrP07309 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
TtrP07309 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
TtrP07309 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
TtrP07309 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
TtrP07309 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
TtrP07309 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
TtrP07309 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
TtrP07309 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
TtrP07309 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
TtrP07309 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
TtrP07309 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
TtrP07309 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
TtrP07309 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
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