Protein–RNA interactions for Protein: P06796

Csn3, Kappa-casein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn3P06796 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Csn3P06796 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Csn3P06796 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
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Csn3P06796 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Csn3P06796 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
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Csn3P06796 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Csn3P06796 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Csn3P06796 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Csn3P06796 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Csn3P06796 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Csn3P06796 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Csn3P06796 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
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Csn3P06796 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Csn3P06796 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Csn3P06796 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Csn3P06796 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Csn3P06796 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Csn3P06796 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Csn3P06796 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Csn3P06796 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Csn3P06796 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Csn3P06796 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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Csn3P06796 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Csn3P06796 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Csn3P06796 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Csn3P06796 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Csn3P06796 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Csn3P06796 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Csn3P06796 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Csn3P06796 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Csn3P06796 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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Csn3P06796 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
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Csn3P06796 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Csn3P06796 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Csn3P06796 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Csn3P06796 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Csn3P06796 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Csn3P06796 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
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Csn3P06796 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Csn3P06796 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Csn3P06796 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Csn3P06796 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Csn3P06796 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Csn3P06796 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
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Csn3P06796 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Csn3P06796 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
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Csn3P06796 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Csn3P06796 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Csn3P06796 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Csn3P06796 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Csn3P06796 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Csn3P06796 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
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Csn3P06796 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
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