Protein–RNA interactions for Protein: P04213

T-cell receptor beta chain V region C5 (Fragment), mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04213 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P04213 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P04213 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P04213 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P04213 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P04213 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P04213 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P04213 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P04213 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P04213 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P04213 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P04213 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P04213 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P04213 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P04213 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P04213 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P04213 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P04213 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P04213 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P04213 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P04213 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P04213 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P04213 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P04213 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P04213 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P04213 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P04213 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P04213 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P04213 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P04213 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P04213 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P04213 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P04213 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P04213 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P04213 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P04213 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P04213 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P04213 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P04213 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P04213 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P04213 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P04213 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P04213 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P04213 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P04213 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P04213 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P04213 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P04213 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P04213 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P04213 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P04213 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P04213 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P04213 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P04213 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P04213 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P04213 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
P04213 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
P04213 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P04213 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P04213 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P04213 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P04213 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P04213 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P04213 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P04213 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P04213 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P04213 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P04213 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P04213 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P04213 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P04213 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P04213 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P04213 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P04213 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P04213 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P04213 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P04213 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P04213 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P04213 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
P04213 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
P04213 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
P04213 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P04213 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P04213 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P04213 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P04213 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P04213 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P04213 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P04213 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P04213 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P04213 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P04213 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P04213 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
P04213 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P04213 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P04213 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P04213 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P04213 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P04213 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P04213 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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