Protein–RNA interactions for Protein: O88587

Comt, Catechol O-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ComtO88587 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ComtO88587 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ComtO88587 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ComtO88587 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ComtO88587 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ComtO88587 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ComtO88587 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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ComtO88587 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ComtO88587 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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ComtO88587 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ComtO88587 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ComtO88587 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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ComtO88587 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ComtO88587 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ComtO88587 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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ComtO88587 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ComtO88587 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ComtO88587 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ComtO88587 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ComtO88587 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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ComtO88587 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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ComtO88587 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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ComtO88587 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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ComtO88587 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ComtO88587 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ComtO88587 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ComtO88587 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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ComtO88587 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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ComtO88587 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ComtO88587 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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ComtO88587 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ComtO88587 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ComtO88587 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ComtO88587 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ComtO88587 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ComtO88587 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ComtO88587 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ComtO88587 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ComtO88587 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ComtO88587 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ComtO88587 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ComtO88587 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ComtO88587 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ComtO88587 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ComtO88587 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ComtO88587 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ComtO88587 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ComtO88587 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ComtO88587 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ComtO88587 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ComtO88587 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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ComtO88587 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ComtO88587 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ComtO88587 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ComtO88587 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ComtO88587 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ComtO88587 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ComtO88587 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ComtO88587 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms