Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
DffaO54786 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
DffaO54786 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
DffaO54786 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
DffaO54786 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
DffaO54786 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
DffaO54786 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
DffaO54786 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
DffaO54786 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
DffaO54786 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
DffaO54786 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
DffaO54786 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
DffaO54786 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
DffaO54786 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
DffaO54786 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
DffaO54786 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
DffaO54786 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
DffaO54786 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
DffaO54786 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
DffaO54786 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
DffaO54786 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
DffaO54786 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
DffaO54786 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
DffaO54786 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
DffaO54786 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
DffaO54786 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
DffaO54786 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
DffaO54786 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
DffaO54786 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
DffaO54786 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
DffaO54786 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
DffaO54786 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
DffaO54786 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
DffaO54786 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
DffaO54786 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
DffaO54786 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
DffaO54786 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
DffaO54786 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
DffaO54786 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
DffaO54786 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
DffaO54786 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
DffaO54786 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
DffaO54786 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
DffaO54786 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
DffaO54786 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
DffaO54786 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
DffaO54786 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
DffaO54786 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
DffaO54786 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
DffaO54786 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
DffaO54786 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
DffaO54786 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
DffaO54786 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
DffaO54786 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
DffaO54786 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
DffaO54786 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
DffaO54786 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
DffaO54786 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
DffaO54786 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
DffaO54786 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
DffaO54786 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
DffaO54786 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
DffaO54786 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
DffaO54786 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
DffaO54786 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
DffaO54786 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
DffaO54786 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
DffaO54786 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
DffaO54786 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
DffaO54786 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
DffaO54786 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
DffaO54786 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
DffaO54786 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
DffaO54786 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
DffaO54786 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
DffaO54786 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
DffaO54786 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
DffaO54786 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
DffaO54786 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
DffaO54786 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
DffaO54786 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
DffaO54786 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
DffaO54786 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
DffaO54786 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
DffaO54786 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
DffaO54786 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
DffaO54786 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
DffaO54786 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
DffaO54786 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
DffaO54786 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
DffaO54786 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
DffaO54786 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
DffaO54786 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
DffaO54786 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
DffaO54786 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
DffaO54786 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
DffaO54786 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
DffaO54786 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
DffaO54786 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
DffaO54786 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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