Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Sp100O35892 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sp100O35892 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sp100O35892 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Sp100O35892 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Sp100O35892 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Sp100O35892 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Sp100O35892 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Sp100O35892 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Sp100O35892 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Sp100O35892 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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